פניות הקשורות למשטרה מועברות על ידי היחידה לגורמים המקצועיים הרלוונטיים. היחידה מקבלת התייחסויות ותגובות מהזרועות.

תלונות מועברות על ידי היחידה ליחידה לתלונות הציבור במשטרת ישראל, ומטעמם נענה המתלונן. היחידה במשרד עוקבת אחר משלוח תשובה.  למתלוננים קיימת זכות להגיש ערר על ממצאי הבדיקה לרמה המקצועית מעל לגורם שהשיב.

תלונות ופניות הקשורות לשירות בתי הסוהר מועברות לקצינת פניות ציבור של שירות בתי הסוהר. במקרים מסוימים ובאישור מבקר המשרד, מתבצעת בדיקה באופן אישי על ידי קצין תלונות אסירים ועצורים (קת"א) או גורם אחר מהאגף.

במקרים מסוימים, על אף שהטיפול בתלונה מול המתלונן הספציפי הסתיים, ממשיכה היחידה לבדוק היבטים מערכתיים אשר עלו מן התלונה.

קיימים מקרים בהם בעקבות תלונות המגיעות ליחידה, נערכות ביקורות נקודתיות באותו נושא.